Kolinlamil mempunyai Tugas Pokok menyelenggarakan operasi angkutan laut militer dalam rangka OMP dan OMSP serta bantuan angkutan laut sesuai dengan perintah Panglima TNI dan bertugas sebagai pembina tunggal kemampuan sistem angkutan laut militer,
membina potensi angkutan laut nasional guna kepentingan pertahanan negara di laut dan membina kesiapan operasional untuk
melaksanakan angkutan laut militer yang meliputi personel, alat-peralatan dan perbekalan baik yang bersifat taktis, strategis maupun administratif yang berkedudukan dan bertanggung jawab kepada Kasal.